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如何检索蛋白质序列库-蛋白质序列怎么看

编辑小哥M
蛋白质
2024-06-16 14:08:21
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简述信息一览：

1、怎样在NCBI上搜索基因序列或者是蛋白质序列?
2、人脂联素蛋白质序列的发卡格式
3、如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列
4、请教:怎么用NCBI查询新城疫病毒F基因的蛋白质序列、氨基酸序列和核苷酸...

怎样在NCBI上搜索基因序列或者是蛋白质序列?

首先，我们打开NCBI***页面，在页面上方搜索框中，选择要下载的基因序列类别，这里我们需要选择“Nucleotide”选项。接下来，我们就需要输入具体的名称了，这里我输入的是Kinase，代表一种酶，然后点击“search”按钮，即可出现搜索结果。点击进入所需要的搜索结果，在页面中左侧，点击“FASTA”按钮。

首先打开NCBI网站首页，然后在search一栏中选择nucleotide，在框中输入你要的基因序列名称，点击search就行。然后会出来很多结果，因为很多基因是同名的，或是一个基因在不同种属中不一样，寻找你要的基因序列就行了。

（图片来源网络，侵删）

首先进入NCBI主页。Map view演示，主要是找到相关基因在染色体上的位置，以人类IL-6基因为例。点击Map View。选择物种，点击Go；设置filter，过滤信息；点击Genes seq查询序列最后进入序列下载页面，可以直接下载。可以选择多种格式，一般选择fasta。

在NCBI（美国国家生物技术信息中心）网站上，你可以使用以下方法来查找基因的相互作用蛋白：访问NCBI主页（https：//）。在搜索栏中输入你感兴趣的基因的名称或标识符。你可以使用官方的基因名称、基因符号、UniProt ID等进行搜索。点击搜索按钮或按下回车键。

打开NCBI 百度搜索键入“NCBI”，点击“搜索”，第一个就是官方主页，点击打开。关键字查找以H9亚型流感病毒HA基因下载为例，说明详细过程。既然要下载基因序列，需要在栏目内找到“Nucleotide”（核苷酸），搜索栏内填入“Avian influenza virus H9 HA”，点击“search”。

（图片来源网络，侵删）

products。单击那个NC_002611（这个是此gene所在的染色体区域），会有两个nucleotide选项，选择FASTA，就连接到NCBI sequence viewer，显示整个gene的序列。

人脂联素蛋白质序列的发卡格式

因为不良的饮食生活习惯会导致肥胖，过度肥胖会引起高血脂等生理疾病，影响脂联素的分泌。根据查询39健康网信息显示，脂联素是一种由脂肪细胞分泌的内源性蛋白质，是一种胰岛素增敏激素，能改善机体的胰岛素敏感性和抑制动脉粥样硬化的发生。

根据对人的基因组进行序列分析所得的结果，人们预测出了近千种G蛋白耦联受体的基因。这些G蛋白偶联受体可以被划分为六个类型，分属其中的G蛋白耦联受体的基因序列之间没有同源关系。

其中第一类即视紫红质样受体包含了绝大多数种类的G蛋白耦联受体。它被进一步分为了19个子类A1-A19。[11]最近，有人提出了一种新的关于G蛋白耦联受体的分类系统，被称为GRAFS，即谷氨酸（Glutamate），视紫红质（Rhodopsin），粘附（Adhesion），Frizzled/Taste2以及分泌素（Secretin）的英文首字母缩写。

从第7位到倒数第2位是发卡银行使用的，包含的内容包括你说的***行位置（发卡城市），***大序列等等，但是具体内容由发卡银行自己定义。

选择Protein-protein BLAST （blastp）；（3）将FASTA格式序列贴入输入栏；（4）点击BLAST；（5）查看与之同源的蛋白质。

如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列

1、Search Tool）是用于序列类似性检索的1个重要数据库，是辨别基因和基因特点的工具。该软件能在15秒内完成全部DNA数据库的序列检索。BLAST记录的相干度有明确的统计学解释，以便更容易地将相干记录与随机的数据库记录像辨别。在NCBI主页的左工具条中，点击BLAST图标，即进入BLAST主页。

2、以常见的牛血清白蛋白（BSA）为例，首先下载BSA的数据库信息首先sp表示，Swiss-Prot数据库是注释精炼的蛋白序列库，它的所有序列都经过了科学家的查阅文献核实（reviewed， manually annotated）。P02769是蛋白在uniprot上的ID号，即蛋白的身份证号。

3、首先，登录Uniprot***（https：//），键入关键词“IL-6”，点击搜索，然后根据研究的物种筛选，即可解锁关于这一关键蛋白的详尽信息。在“Function”模块，你会发现IL-6的基本功能及其在生物学过程中扮演的角色，每一条功能描述后都附有参考文献，如同打开知识宝库的钥匙（Function界面）。