如何检索蛋白质信息-如何检索蛋白质信息内容

文章阐述了关于如何检索蛋白质信息，以及如何检索蛋白质信息内容的信息，欢迎批评指正。

简述信息一览：

• 1、uniprot怎么看蛋白序列是通过实验获得的
• 2、怎么查找蛋白功能?
• 3、要查一个蛋白在哪些细胞中有表达,有什么方法?具体点
• 4、您好,向您求助下,如何查找某蛋白质的转录因子有哪些?
• 5、如何查找某一蛋白质结构域的结合蛋白或者基因
• 6、请教:怎么用NCBI查询新城疫病毒F基因的蛋白质序列、氨基酸序列和核苷酸...

uniprot怎么看蛋白序列是通过实验获得的

拿到蛋白质组学鉴定结果后，看懂数据库当然是第一步的。以常见的牛血清白蛋白（BSA）为例，首先下载BSA的数据库信息 首先sp表示，Swiss-Prot数据库是注释精炼的蛋白序列库，它的所有序列都经过了科学家的查阅文献核实（reviewed， manually annotated） 。P02769是蛋白在uniprot上的ID号，即蛋白的身份证号。

首先，登录Uniprot***（https：//），键入关键词“IL-6”，点击搜索，然后根据研究的物种筛选，即可解锁关于这一关键蛋白的详尽信息。在“Function”模块，你会发现IL-6的基本功能及其在生物学过程中扮演的角色，每一条功能描述后都附有参考文献，如同打开知识宝库的钥匙（Function界面）。

当应用BLAST软件比较某氨基酸或DNA序列与库中其他氨基酸或DNA序列差异即进行类似性检索时，则会触及到蛋白质库或核苷酸库的库内链接。库间链接产生在核苷酸数据库内的记录与PubMed库中已发表序列的引文间的链接，或蛋白质序列记录与核苷酸序列库中编码它的核苷酸序列间的链接。

首先打开电脑主界面，在主界面点击浏览器进入。其次搜索UniProt数据库，点击进入。最后再序列条目总数查询即可。

基本过程是将蛋白质被打成单电荷片段，通过电磁偏转得到一系列长度不等的片段，由于可测得质量，将片段排序，就可知道某个位点的氨基酸的质量，进而得知氨基酸的种类，重复此过程，可得知所有氨基酸的种类，进而得知蛋白质的序列，一般都是以及序列的信息，毕竟蛋白质测序之前要经过预处理。

怎么查找蛋白功能?

如果没有参考文献，你就去NCBI上的pubmed中检索这个蛋白，可以找到类似的文献就可以知道其功能了。具体工作还是要你自己去找喽。

如果基因是已知的，那从NCBI上的gene数据库可以直接查到其编码蛋白是什么，然后再在蛋白质数据库输入蛋白质名称就能查到其功能。如果是未知的，就用NCBI中blastx功能可以查看这个基因的编码产物是否与其他蛋白质类似，推断其功能。

方法比较简单，取一条试纸，浸入被检尿内，立即取出，约10～20分钟，观察有无蓝色显示。如无变化为阴性，显蓝色，即把所呈颜色；碱性尿液可出现假阳性，因此，在试验前先用石蕊试纸检查一下尿的酸碱度，如为碱性）在PH0以上），应先加几滴醋酸，使尿呈酸必再做。

输入基因号：在数据库的搜索栏中输入一个基因号，然后点击搜索按钮。一些数据库支持同时输入多个基因号，您可以将整个基因号列表一次性***粘贴到搜索栏中。 获取蛋白名称：数据库会返回与每个基因号相关联的蛋白信息。通常会提供蛋白名称、序列、功能注释等相关信息。

在NCBI（美国国家生物技术信息中心）网站上，你可以使用以下方法来查找基因的相互作用蛋白： 访问NCBI主页（https：//）。 在搜索栏中输入你感兴趣的基因的名称或标识符。你可以使用官方的基因名称、基因符号、UniProt ID等进行搜索。 点击搜索按钮或按下回车键。

要查一个蛋白在哪些细胞中有表达,有什么方法?具体点

Top down是指从一个完整的蛋白出发，在质谱中进行碎片化处理，通过对碎片分子的检测，推导出蛋白的序列。而在使用中真正占绝大多数是Bottom-up方法，也就是我们常说的shotgun方法，它充分利用了蛋白质自身的特点：可以被特定的酶在特定的位点切断。

免疫组织化学的全过程包括：抗原的提取与纯化；免疫动物或细胞融合，制备特异性抗体以及抗体的纯化；将显色剂与抗体结合形成标记抗体；标本的制备；免疫细胞化学反应以及呈色反应；观察结果。

目前， MSI 检测方法主要有三种：IHC 方法使用相应的抗体，通过对 4 种 DNA 错配修复蛋白（ MLH1 ， PMS2 ， MSH2 ， MSH6 ）在细胞核内的表达情况，来确定细胞内是否存在错配修复功能缺陷。

您好,向您求助下,如何查找某蛋白质的转录因子有哪些?

1、你要纯化蛋白并对其进行序列和结构分析，2你要将蛋白的和DNA的结合部位找到（ChIP可以做到，需要的是能制备蛋白的抗体）3 酵母单杂交，在报告基因上游克隆你的蛋白结合的启动子，将你的目标蛋白加入体系看能否表达，表达就说明是转录因子，否则不是。

2、作为蛋白质的转录因子从功能上分析其结构可包含有不同区域：①DNA结合域（DNA binding domain），多由60-100个氨基酸残基组成的几个亚区组成；②转录激活域（activating domain），常由30-100氨基酸残基组成，这结构域有富含酸性氨基酸、富含谷氨酰胺。

3、真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录机构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所必须的。一般可将这些转录所需的蛋白质分为三大类：（1）RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。

如何查找某一蛋白质结构域的结合蛋白或者基因

1、去blast里面查询，SpecializedBLAST里面的“SearchproteinornucleotidetargetsinPubChemBioAssay”，点击protein链接，把序列输入里面查询就可以了。结构域是生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域，特别指蛋白质中这样的区域。

2、网址中输入NCBI，点开NCBI主页。在主页的右上方有可选框，选择protein，后面输入蛋白名称，如果想具体找到的话，直接输入物种加蛋白，回车即可。打开NCBI主页。左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称。

3、回复 沧海蓝天★：description 是对结构的描述信息，你说的ABC结构域，如果有的话，在description里面会有关键词“ABC”。PDB是存储蛋白质结构的数据库，也可用NCBI的conserved domain description 查询看有没有相应的记录，如果是查这个的话，记录结果会更多。查询的范围要靠慢慢了解去选择的。

4、访问NCBI主页（https：//）。 在搜索栏中输入你感兴趣的基因的名称或标识符。你可以使用官方的基因名称、基因符号、UniProt ID等进行搜索。 点击搜索按钮或按下回车键。 在搜索结果页面中，你将看到与你搜索的基因相关的多个选项。

5、又称为足印法（footprinting）是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位，可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。其原理为：DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解，在测序时便出现空白区（即蛋白质结合区），从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。

请教:怎么用NCBI查询新城疫病毒F基因的蛋白质序列、氨基酸序列和核苷酸...

1、首先打开NCBI网站首页，然后在search一栏中选择nucleotide，在框中输入你要的基因序列名称，点击search就行。然后会出来很多结果，因为很多基因是同名的，或是一个基因在不同种属中不一样，寻找你要的基因序列就行了。

2、选择“gene”，输入“基因名”，点击”search“，点击“基因名“，页面拉到”NCBI Reference Sequences （RefSeq）“，点击”genbank“，即可得。

3、直接把这个基因进行查询，在不同的模块下就有不同的信息：比如在Gene数据库就会显示geneID，染色***置信息等。在Nucleotido中就可查到对应的核苷酸序列。其实你任意点进去一个，在仔细找里面的链接也OK。

4、打开NCBI 百度搜索键入“NCBI”，点击“搜索”，第一个就是官方主页，点击打开。关键字查找 以H9亚型流感病毒HA基因下载为例，说明详细过程。既然要下载基因序列，需要在栏目内找到“Nucleotide”（核苷酸），搜索栏内填入“Avian influenza virus H9 HA”，点击“search”。

5、当已知基因名或ID时，可通过NCBI搜索基因序列。首先登陆NCBI***，在下拉菜单选择gene，搜索基因名或ID。NCBI： https：// 这里选取一个调节根系发育的基因AT5G61350进行示例。

6、电脑浏览器百度搜索NCBI，直接点击图示链接进入。下一步打开其中的首页，需要搜索对象并选择跳转。这个时候如果没问题，就继续确定浏览所查询的蛋白质。这样一来等得到相关的结果以后，即可实现要求了。

关于如何检索蛋白质信息，以及如何检索蛋白质信息内容的相关信息分享结束，感谢你的耐心阅读，希望对你有所帮助。